第1部分第2部分第3部分
卷上一、元气亏损内伤外感等症二、饮食劳倦亏损元气等症三、脾胃亏损心腹作痛等症四、脾肾虚寒阳气脱陷等症五、命门火衰不能生土等症六、肾虚火不归经发热等症七、脾胃亏损吞酸嗳腐等症八、脾肾亏损停食泄泻等症九、
串雅内外编
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
和序廉序吴序罗序自序卷上决证诗赋观形气及幼攻补戒毁同道为医先去贪嗔辨证早决安危五色主病诊脉明证议金银薄荷胎寒藏寒胎热弄舌舒舌脐风脐突夜啼急惊天钓急惊后如疟慢惊搐证诸风毒破血伤风伤积惊积诸热吐泻伤寒伤风
序风温夹食时湿温暑风兼疹暑湿白红疹紫斑春温逆入心包伏暑伏暑内闭热入营分热入厥阴热邪消烁津液阴虚阳浮阴斑伏暑夹食霍乱夹食霍乱遗湿风斑寒水袭肺内燥冬温痰火暑风化疟阴疟肝胃瘅疟气虚下陷暑湿泄泻脾虚泄泻白积暑
提要上部中部下部十不治症一治通身药末方验愈
并言卷上神字号玉华散圣字号通利散功字号积雪膏巧字号定风针附 风热喉辨方附 积热喉辨方附 痰热喉辨方附 虚热喉辨方附 针灸须知附志卷下单鹅风双鹅风单口风松子风搭颊风外锁风斗底风木舌风重舌风莲花舌牙蜞风双
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷